Dicho Fondo será gestionado y administrado por el Departamento de Desarrollo Ambiental, a través de la División Saneamiento y del Servicio de Administración de Saneamiento.
Los Municipios, el Departamento de Desarrollo Ambiental y/o el Departamento de Desarrollo Urbano, podrán gestionar solicitudes del Fondo de Saneamiento participando desde su órbita de competencia, siendo que tengan bajo su responsabilidad algún tipo de programa y/o para beneficiarios individuales y que desee utilizar este apoyo financiero para concretar conexiones a la red de saneamiento, para dar respuesta integral, participativa, y de anclaje territorial para combatir los perjuicios sanitarios, sociales y económicos.